Nato a Pesaro il 15 gennaio 1976, Baioni comincia la sua carriera come istruttore di minibasket e giovanile. Nella stagione 2001/2002 è assistente della Falco Pesaro in B Eccellenza. La stagione successiva approda alla Vuelle dove comincia come allenatore delle formazioni giovanili. Nella stagione 2003/2004 viene chiamato come assistente della Nazionale Under 16 ed inizia a collaborare anche con la prima squadra pesarese, di cui diventa assistente a tempo pieno nella stagione 2005/2006 in B Eccellenza, ottenendo la promozione in Legadue e l’anno successivo quella nella massima serie. Nella stagione 2007/2008 viene chiamato come assistente della Nazionale Under 18 e prosegue la sua esperienza di assistente dei biancorossi, con i quali partecipa all’Eurochallenge arrivando alle Final Four di Gottingen (2009/2010). Nella stagione 2010/2011 l’approdo alla Montepaschi, con cui vince Supercoppa, Coppa Italia e Scudetto e raggiunge la Final Four a Barcellona. La stagione 2011/2012 comincia con la vittoria della Supercoppa Italiana e prosegue con il successo in Coppa Italia, riportato nel Febbraio 2012.